Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01724 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01724 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01724 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01724 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01724 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01724 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01724 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01724 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01724 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P01724 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01724 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01724 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01724 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01724 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01724 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01724 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01724 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01724 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01724 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01724 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01724 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01724 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01724 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01724 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01724 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01724 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01724 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01724 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01724 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01724 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01724 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01724 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01724 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01724 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01724 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01724 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01724 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01724 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01724 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01724 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01724 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01724 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01724 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01724 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01724 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01724 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01724 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01724 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01724 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01724 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01724 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01724 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01724 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01724 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01724 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01724 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01724 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01724 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01724 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01724 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01724 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01724 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01724 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01724 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01724 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01724 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
P01724 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01724 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01724 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01724 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01724 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01724 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01724 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01724 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01724 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01724 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01724 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01724 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01724 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01724 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01724 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01724 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01724 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01724 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01724 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01724 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01724 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01724 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
P01724 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01724 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01724 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01724 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01724 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01724 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01724 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01724 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01724 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01724 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01724 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms