Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psma3O70435 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psma3O70435 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psma3O70435 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psma3O70435 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psma3O70435 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psma3O70435 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Psma3O70435 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psma3O70435 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psma3O70435 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psma3O70435 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Psma3O70435 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psma3O70435 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psma3O70435 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psma3O70435 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psma3O70435 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psma3O70435 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psma3O70435 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psma3O70435 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psma3O70435 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psma3O70435 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psma3O70435 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Psma3O70435 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psma3O70435 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psma3O70435 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psma3O70435 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psma3O70435 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psma3O70435 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Psma3O70435 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psma3O70435 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Psma3O70435 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psma3O70435 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psma3O70435 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma3O70435 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Psma3O70435 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psma3O70435 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psma3O70435 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms