Protein–RNA interactions for Protein: O70194

Eif3d, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3dO70194 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eif3dO70194 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3dO70194 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3dO70194 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Eif3dO70194 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3dO70194 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms