Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top3aO70157 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top3aO70157 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top3aO70157 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top3aO70157 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top3aO70157 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top3aO70157 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3aO70157 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Top3aO70157 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3aO70157 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top3aO70157 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top3aO70157 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top3aO70157 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3aO70157 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3aO70157 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3aO70157 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms