Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RaxO35602 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RaxO35602 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RaxO35602 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RaxO35602 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RaxO35602 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RaxO35602 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RaxO35602 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RaxO35602 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RaxO35602 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaxO35602 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaxO35602 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaxO35602 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaxO35602 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaxO35602 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaxO35602 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaxO35602 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RaxO35602 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaxO35602 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaxO35602 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RaxO35602 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RaxO35602 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RaxO35602 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RaxO35602 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RaxO35602 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RaxO35602 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RaxO35602 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RaxO35602 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RaxO35602 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RaxO35602 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RaxO35602 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RaxO35602 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RaxO35602 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RaxO35602 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RaxO35602 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RaxO35602 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RaxO35602 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RaxO35602 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RaxO35602 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RaxO35602 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RaxO35602 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RaxO35602 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RaxO35602 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RaxO35602 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RaxO35602 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RaxO35602 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RaxO35602 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RaxO35602 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RaxO35602 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RaxO35602 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RaxO35602 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RaxO35602 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RaxO35602 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RaxO35602 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RaxO35602 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RaxO35602 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RaxO35602 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RaxO35602 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RaxO35602 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RaxO35602 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RaxO35602 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RaxO35602 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RaxO35602 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RaxO35602 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RaxO35602 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RaxO35602 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RaxO35602 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RaxO35602 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RaxO35602 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RaxO35602 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RaxO35602 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RaxO35602 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RaxO35602 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RaxO35602 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RaxO35602 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RaxO35602 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RaxO35602 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RaxO35602 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RaxO35602 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RaxO35602 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RaxO35602 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RaxO35602 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RaxO35602 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RaxO35602 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RaxO35602 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RaxO35602 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RaxO35602 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RaxO35602 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RaxO35602 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RaxO35602 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RaxO35602 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaxO35602 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaxO35602 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaxO35602 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaxO35602 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaxO35602 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaxO35602 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaxO35602 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RaxO35602 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RaxO35602 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.4 ms