Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Abcc1O35379 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Abcc1O35379 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abcc1O35379 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Abcc1O35379 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abcc1O35379 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abcc1O35379 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abcc1O35379 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Abcc1O35379 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Abcc1O35379 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abcc1O35379 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc1O35379 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc1O35379 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc1O35379 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Abcc1O35379 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Abcc1O35379 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc1O35379 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Abcc1O35379 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Abcc1O35379 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Abcc1O35379 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Abcc1O35379 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Abcc1O35379 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Abcc1O35379 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abcc1O35379 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abcc1O35379 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abcc1O35379 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Abcc1O35379 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Abcc1O35379 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Abcc1O35379 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Abcc1O35379 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Abcc1O35379 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms