Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd9O35177 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nedd9O35177 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd9O35177 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms