Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp35M0QWN7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp35M0QWN7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp35M0QWN7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp35M0QWN7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp35M0QWN7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp35M0QWN7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp35M0QWN7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp35M0QWN7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp35M0QWN7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp35M0QWN7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp35M0QWN7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms