Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20538F6Z9R1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms