Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
3110082J24RikF6Z6Z2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms