Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21974F6W3F3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21974F6W3F3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21974F6W3F3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21974F6W3F3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21974F6W3F3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21974F6W3F3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21974F6W3F3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21974F6W3F3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21974F6W3F3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21974F6W3F3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms