Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
R3hdm1E9Q9Q2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3hdm1E9Q9Q2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3hdm1E9Q9Q2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
R3hdm1E9Q9Q2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms