Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Arhgef5E9Q7D5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Arhgef5E9Q7D5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Arhgef5E9Q7D5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Arhgef5E9Q7D5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Arhgef5E9Q7D5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Arhgef5E9Q7D5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Arhgef5E9Q7D5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Arhgef5E9Q7D5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Arhgef5E9Q7D5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Arhgef5E9Q7D5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Arhgef5E9Q7D5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Arhgef5E9Q7D5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Arhgef5E9Q7D5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Arhgef5E9Q7D5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Arhgef5E9Q7D5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Arhgef5E9Q7D5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Arhgef5E9Q7D5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Arhgef5E9Q7D5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Arhgef5E9Q7D5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Arhgef5E9Q7D5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Arhgef5E9Q7D5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Arhgef5E9Q7D5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Arhgef5E9Q7D5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Arhgef5E9Q7D5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Arhgef5E9Q7D5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms