Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt90E9Q1Z0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt90E9Q1Z0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms