Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc171E9Q1U1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc171E9Q1U1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc171E9Q1U1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc171E9Q1U1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms