Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Myo5cE9Q1F5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Myo5cE9Q1F5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Myo5cE9Q1F5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Myo5cE9Q1F5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
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