Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
9630041A04RikD3Z3U4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
9630041A04RikD3Z3U4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9630041A04RikD3Z3U4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms