Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rexo5D3YW29 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rexo5D3YW29 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms