Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3173A6NAS3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3173A6NAS3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3173A6NAS3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3173A6NAS3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms