Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ88

Pnpla7, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla7A2AJ88 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pnpla7A2AJ88 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pnpla7A2AJ88 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pnpla7A2AJ88 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pnpla7A2AJ88 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pnpla7A2AJ88 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pnpla7A2AJ88 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pnpla7A2AJ88 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pnpla7A2AJ88 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pnpla7A2AJ88 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pnpla7A2AJ88 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Pnpla7A2AJ88 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 686.6 ms