Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUK1

AW822073, Expressed sequence AW822073, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW822073A0A0N4SUK1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AW822073A0A0N4SUK1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AW822073A0A0N4SUK1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AW822073A0A0N4SUK1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AW822073A0A0N4SUK1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AW822073A0A0N4SUK1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AW822073A0A0N4SUK1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AW822073A0A0N4SUK1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AW822073A0A0N4SUK1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms