Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSG3

Gm28269, MCG1047152, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28269A0A087WSG3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15,56■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,55■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,55■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15,55■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,55■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,54■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,54■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15,54■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15,54■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15,52■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,51■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15,5■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,5■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15,5■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15,49■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15,49■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15,48■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15,48■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,46■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Gm28269A0A087WSG3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15,45■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms