Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B020011L13RikA0A087WQI7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B020011L13RikA0A087WQI7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms