Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm28919A0A087WP35 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm28919A0A087WP35 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28919A0A087WP35 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm28919A0A087WP35 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm28919A0A087WP35 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28919A0A087WP35 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28919A0A087WP35 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28919A0A087WP35 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28919A0A087WP35 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28919A0A087WP35 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28919A0A087WP35 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28919A0A087WP35 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28919A0A087WP35 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28919A0A087WP35 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms