Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms