Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms