Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK3Q9BYB0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms