Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD4Q96M96 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms