Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Arhgef39Q66JY6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Arhgef39Q66JY6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Arhgef39Q66JY6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Arhgef39Q66JY6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Arhgef39Q66JY6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Arhgef39Q66JY6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Arhgef39Q66JY6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Arhgef39Q66JY6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arhgef39Q66JY6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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