Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms