Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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