Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms