Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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