Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms