Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms