Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA4P35212 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms