Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms