Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIG1P18858 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LIG1P18858 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LIG1P18858 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
LIG1P18858 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LIG1P18858 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LIG1P18858 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LIG1P18858 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIG1P18858 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIG1P18858 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms