Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB3P16520 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB3P16520 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms