Protein–RNA interactions for Protein: O35231

Kifc3, Kinesin-like protein KIFC3, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc3O35231 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Kifc3O35231 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Kifc3O35231 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Kifc3O35231 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Kifc3O35231 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Kifc3O35231 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kifc3O35231 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Kifc3O35231 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kifc3O35231 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kifc3O35231 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms