Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms