Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms