Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP8AP2Q9UKL3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms