Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA1Q9NP55 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA1Q9NP55 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA1Q9NP55 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA1Q9NP55 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA1Q9NP55 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BPIFA1Q9NP55 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA1Q9NP55 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms