Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NICN1Q9BSH3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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