Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYD88Q99836 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms