Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms