Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms