Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms