Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms